Item – Thèses Canada

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Numéro d'OCLC
1202597601
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Exemplaire de BAC
Auteur
Dumont-Leblond, Nathan,
Titre
Développement d'une méthode robuste de caractérisation du microbiote de tissus pulmonaires tumoraux
Diplôme
Maître ès sciences (M. Sc.) -- Université Laval, 2020
Éditeur
Québec : Université Laval, 2020
Description
1 ressource en ligne (x, 68 pages) :illustrations, fichier PDF (3,45 Mo)
Notes
Titre de l'écran-titre (visionné le 17 novembre 2020)
Bibliographie : pages 54-68
Résumé
Bien que longtemps considérés stériles, il est maintenant confirmé que les poumons sont peuplés d'une communauté microbienne diversifiée. De plus, il a récemment été observé que les microorganismes peuplant le corps humain peuvent influencer le développement du cancer et son traitement dans l'intestin et le pancréas. Cependant, peu d'études ont tenté de caractériser le microbiote pulmonaire et son impact sur le cancer du poumon. Davantage d'efforts se doivent d'y être consacrés. L'absence de standardisation méthodologique et de considération pour les contraintes de l'environnement pulmonaire diminuent par contre la validité des résultats obtenus et des conclusions qui peuvent être faites actuellement. Le présent projet propose donc le développement d'une démarche expérimentale appropriée à la caractérisation du microbiote tumoral pulmonaire. Nous avons mis sur pied une marche à suivre complète, allant du recrutement de patients au traitement des données bioinformatiques. Nous avons minimisé l'incorporation de microorganismes contaminants et avons établi des points de contrôle afin de les détecter et de les retirer des échantillons. La combinaison de méthodes d'homogénéisation enzymatiques et mécaniques et d'une trousse d'extraction d'ADN commerciale a permis une détection rapide et fiable du microbiote. L'utilisation des communautés microbiennes de composition connue, autant de cellules entières («whole») que de génomes, a permis de confirmer que notre capacité de récupération bactérienne est adéquate et que l'abondance d'ADN humain dans les extraits pulmonaires n'a pas d'influence significative sur notre capacité de détection. La signature bactérienne des tissus cancéreux et sains de cinq patients a pu être différenciée de celles des contrôles méthodologiques. Nos travaux approfondissent les connaissances nécessaires à l'étude d'environnements microbiens faiblement peuplés. Ils sont un point de départ vers la standardisation méthodologique et l'implémentation de précautions d'échantillonnage appropriées pour l'étude du microbiote pulmonaire.
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Sujet
Lungs Microbiology.
Lungs Cancer.
Poumons Microbiologie.
Poumons Cancer.
Microbiote.
Poumons -- Microbiologie.
Poumons -- Cancer.